Unsere Forschung konzentriert sich auf die Entwicklung und Anwendung innovativer Algorithmen zur Analyse biomedizinischer Daten, insbesondere im Bereich der Sequenzanalyse und der Datenvisualisierung. Ein zentraler Schwerpunkt liegt auf der Chaos Game Representation (CGR), einer Methode, die es ermöglicht, biologische Sequenzen zu visualisieren. Diese Methode wird insbesondere für die vergleichende Analyse von DNA- und Proteinsequenzen genutzt und ermöglicht eine präzise Extraktion von Merkmalen, die für maschinelles Lernen und tiefes Verständnis biologischer Daten erforderlich sind.

Dabei erforschen wir, wie CGR und verwandte Ansätze die bioinformatische Analyse verbessern können, indem sie Sequenzen in zweidimensionale Bilder oder Matrizen umwandeln. Dies erleichtert die Identifikation von Mustern und ermöglicht eine tiefere Analyse von sequentiellen Daten ohne den Einsatz klassischer Alignments. Unsere Forschung umfasst dabei Anwendungen in der Phylogenie, der Proteinsequenzklassifikation, der Entwicklung neuer Analysemethoden für Omics-Daten sowie der Optimierung maschineller Lernverfahren, die mit CGR-generierten Daten arbeiten, sowie der Anwendung von CGR zur  Entwicklung von Algorithmen für die Speicherung und Verarbeitung von Daten in DNA.


Leitung der Arbeitsgruppe
Dr. rer. nat. Hannah Franziska Löchel