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Biomedical Informatics

Die bioinformatische Forschung in der Medizin trägt in erheblichem Maße zum Erkenntnisgewinn in der Gesundheitsforschung, vor allem in der Krebsforschung bei.
Die medizinische Bioinformatik stützt sich auf die Auswertung von biologischen Massendaten, bei der der Einsatz von Computern verbunden mit zuverlässigen mathematischen Modellen und Algorithmen unumgänglich sind.
In zahlreichen Kooperationen mit unseren deutschlandweiten und internationalen Klinikpartnern hat unser Institut eine umfangreiche Expertise in der Bearbeitung bioinformatischer medizinischer Forschungsfragen erlangt.

Leitung der Arbeitsgruppe
PD Dr. Sarah Sandmann

Beratung & Kooperation

Wir bieten eine Beratung und Kooperation für folgende Forschungsthemen an:

  • DNA-seq (targeted, WES, WGS; matched- und non-matched; color space): Varianten Calling, Mutational Patterns, Klonale Evolution, Ethnizität, Verwandtschaft,
  • RNA-seq (bulk): Expressions-Analyse, Fusionsgene,
  • Spatial Transcriptomics (z.B. 10x Visium und Nanostring): Expressions-Analyse, Cluster-Analyse,
  • Single cell omics (RNA-seq, z.B. 10x Genomics, Parse Biosciences und Drop-Seq; ATAC-seq): Expressions-Analyse, Cluster-Analyse, Velocity,
  • Microarrays (SNP, aCGH, gene expression, 850K, 450K): CNV Calling, Expressions-Analyse, Methylierungs-Analyse,
  • Bisulfite sequencing (RRBS, WGBS): Methylierung,
  • ChIP-seq:  Transkriptionsfaktor Bindungsstellen, Histone,
  • 4C-seq, Hi-C-seq: 3D Chromatin Struktur,
  • ATAC-seq: Chromatin Struktur,
  • Proteomics: Cluster-Analyse,
  • Lipidomics: Cluster-Analyse,
  • Zusätzlich: Pathway-Analysen, Geneset Enrichment, Datenintegration und -annotation.

Die Anmeldung zur Beratung kann sowohl per E-Mail als auch telefonisch durchgeführt werden.

Kontakt: biomedical.informatics@uni-muenster.de
Tel.: 0251 / 83 – 5 52 70

Abgeschlossene Projekte